O trevo negro se concentra em Asta e Yuno, duas crianças que foram abandonadas na mesma igreja e que desde então se tornaram amigos inseparáveis. Yuno possui habilidades mágicas incríveis, enquanto Asta treina fisicamente para compensar sua falta de magia. Aos 15 anos de idade, os dois entram em conflito ao procurarem o mesmo objetivo: tornar-se o próximo Imperador Mago.