Universal Century 0096, na colônia Industrial 7, Banagher Links é contado por sua intuição para salvar uma garota. Acontece que esta garota, Audrey Burne, está em fuga para avisar a Fundação Vist de que uma guerra vai deflagrar. Durante a negociação, a colônia é atacada por fatos móveis Neo Zeon que estão atrás de algo chamado Laplace's Box. Durante o caos, Banagher é entregue a um Gundam e é informado de que ele é a chave para a abertura da caixa. Escapando da colônia e em posse de um Gundam super poderoso, Banagher tem que se misturar nas lutas entre a Federação da Terra, uma princesa Zabi, o Capitão Frontal Completo e a Fundação Vist. O que é esta Caixa de Laplace e por que todos estão atrás dela? Banagher pode decidir fazer a coisa certa com a chave que supostamente sustenta o futuro?