De volta para uma segunda temporada, a Cidade Secreta volta 2 anos depois de Harriet Dunkley passar um tempo em uma Prisão Federal. É claro que há outra teia política de enganos e toda uma conspiração para Harriet Dunkley desvendar. À medida que a trama engrossa e as peças começam a cair no alinhamento, a estação se desenvolve até um clímax, mas um tanto instigante, destacando os perigos em torno da tecnologia e de nossas próprias percepções de guerra.